ธงชาติเปอร์โตริโก เป็นธงประจำเครือรัฐในพิทักษ์ของสหรัฐอเมริกา. และใช้ในกิจกรรมต่าง ๆ อันสื่อถึงชาวเปอร์โตริโก เช่น กิจกรรมการเมือง การแข่งขันกีฬาระดับนานาชาติ. ซึ่งธงนี้มีความแตกต่างในการสลับตำแหน่งแถบสีบนธงชาติ นั่นคือ ธงชาติเปอร์โตริโก จะเป็นแถบสีแดง สามเหลี่ยมสีน้ำเงิน และ ธงชาติคิวบา จะเป็นแถบสีน้ำเงิน สามเหลี่ยมสีแดง.
ธงที่ใช้ในปัจจุบัน ประกาศใช้ครั้งล่าสุดเมื่อ ค.ศ. 1952, ซึ่งมีต้นกำเนิดจาก "ธงขบวนการปฏิวัติราเลซ" เป็นธงชาติผืนแรกที่ประกาศอย่างเป็นทางการเมื่อ ค.ศ. 1868, โดยใช้ในขบวนการปฏิวัติ ระหว่างการเรียกร้องเอกราชจากสเปน ที่รู้จักกันในชื่อว่า, "El Grito de Lares".
แม่แบบ:ประเทศเปอร์โตริโก แม่แบบ:สัญลักษณ์ของประเทศเปอร์โตริโก แม่แบบ:ธงประจำรัฐในประเทศสหรัฐอเมริกา
