สัตว์มีแกนสันหลัง (ชื่อวิทยาศาสตร์: Chordata) เป็นไฟลัมหนึ่งของสัตว์มีกระดูกสันหลัง ซึ่งรวมทั้งสิ่งมีชีวิตที่มีกระดูกสันหลัง และสัตว์ไม่มีกระดูกสันหลังในตระกูลที่ใกล้ชิดอีกหลายชนิด สิ่งมีชีวิตสองชนิดนี้ เป็นหนึ่งเดียวกันในระยะการเจริญเติบโตบางช่วงของชีวิต แกนสันหลัง ใยประสาทส่วนหลังกลวง ช่องคอหอย หลอดเส้นประสาทกลวงส่วนหลัง และส่วนหางที่แข็งแรงขยายผ่านช่องทวารหนัก อย่างไรก็ตามนักวิทยาศาสตร์บางคนให้เหตุผลว่า คุณสมบัติที่แท้จริงน่าจะเป็นถุงช่องที่ช่องคอหอย
ไฟลัมของสัตว์มีแกนสันหลังสามารถแตกออกเป็นไฟลัมย่อยได้หลากหลายไฟลัม เช่น ไฟลัมยูโรคอร์ดาตา (Urochordata), ไฟลัมเซฟาโลคอร์ดาตา (Cephalochordata) และ ไฟลัมสัตว์มีกระดูกสันหลัง (Vertebrata) ตัวอ่อนของยูโรคอร์เดตมีแกนสันหลัง และใยประสาท และมันจะหายไปเมื่อโตเต็มวัย เซฟาโลคอร์เดตมีแกนสันหลังและใยประสาทแต่ไร้กระดูกสันหลัง ส่วนในสัตว์มีกระดูกสันหลัง แกนสันหลังจะแทนที่ด้วยไขสันหลังแทน
หมายเหตุ: เส้นแสดงถึงความสัมพันธุ์ของวิวัฒนาการของสิ่งมีชีวิต (รวมถึงสัตว์ที่สูญพันธุ์แล้ว)